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文檔簡介
1、目的:研究黃河三角洲近海岸區域古菌的多樣性及分布。
方法:以PCR技術為基礎構建古菌16S rDNA基因文庫,在小尺度上選擇6個不同站位的沉積物樣品進行研究。
結果:1.經研究處理后共獲得了568個克隆,擴增所得的16S rRNA基因經過限制性雙酶切分析及應用軟件DOTUR進行97% cut off后共得到73個有效操作分類單元(Operational Taxonomic Unit,OUTs)。2.所有陽性克隆經雙酶
2、切后進行測序,通過網上進行序列比對通過傳統統計學方法及所獲基因構建系統發育樹。3.對實驗獲得的16S rDNA分析發現,本次研究的古菌均來自泉生古菌(Crenarchaeota)和廣生古菌(Euryarchaeota)兩大類。其中,Marine Crenarchaeotic Group I(MG- I)(88.8%)占據了主要地位,接下來依次為Miscellaneous Crenarchaeotic Group(MCG);DSAG(De
3、ep-Sea Archaeal Group)也稱為MBG-B;MBG-D,也稱MG-III(Marine Group III)以及、TMEG(Terrestrial Miscellaneous Eurarchaeotal Goup)。
結論:結果反映,MG-I與 MCG這兩個古菌類群的克隆數占16SrDNA總克隆數的96%,兩者均是海洋中最為常見的古菌類群,這也符合近海環境較為穩定的特點。近海沉積物中古菌群落結構在水平范圍并沒
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